リンクタイプのメリットは、安全性にあります。
なぜなら、PCIDSSに完全準拠しているペイジェントの環境に遷移した後で、ユーザがカード情報を入力するからです。
なお、決済画面のデザインを加盟店様でカスタマイズいただけるよう、CSS対応など準備中です。
デメリットとしては、現在ご利用のモジュールタイプからリンクタイプへ丸ごと切り替えると、やはり工数がかかるという点です。
ただし、ユーザがカード情報を入力する画面のみをリンクにし、裏側の仕組みは従来のモジュールを使い続ける、リンク＋モジュールにすることで、改修コストを最小限に抑えた方法もございます。（詳細については一度、貴社システム担当者様にご相談ください）